勝村演じる加地は「腹腔鏡の魔術師」と崇められるほど腕がいいが、金には汚い外科医。『ドクターX』には第１シリーズから登場し、その憎めない言動で絶大な人気を獲得してきました。そんな加地が『ドクターY』ではなんと、茨城県の大洗にある「帝都医科大学付属病院　大洗第８分院」に転勤します！　東京から来たスーパードクターともてはやされ、まんざらでもない加地。そんな折、代議士の娘が虫垂炎で入院することに。時を同じくして、加地が道で助けた貧乏な老人も入院し、重篤な難病であることが判明します。目の前に同時に現れた“金持ちで簡単な手術の患者”と“貧乏で難しい手術の患者”。そんな中、加地は代議士の娘の手術を優先しようとするのですが…!? 　　群れを好み、金を愛し、腹腔鏡のスキルと要領の良さだけが武器――そんなドクターYこと外科医?加地秀樹は“医師”として、最後にどんな選択をするのか!?　その行方に注目です。